衢州市發展和改革委員會
衢州市經濟和貿易委員會
衢州市教育局
衢州市科學技術局
衢州市民族宗教事務委員會
衢州市公安局
衢州市審計局
衢州市人民政府外事辦公室
衢州市人口和計劃生育委員會
衢州市文化局
衢州市林業局
衢州市農業局
衢州市勞動和社會保障廳（改組為人力資源和社會保障局）
衢州市衛生局
衢州市交通運輸局
衢州市住房和城鄉建設局
衢州市商務局
衢州市水利局
衢州市環境保護局
衢州市民政局
衢州市國土資源局
衢州市人事局（改組為人力資源和社會保障局）
衢州市財政局
衢州市司法局
衢州市監察局 衢州市人民防空辦公室
衢州市人民政府研究室
衢州市人民政府法制辦公室
衢州市旅遊局
衢州市糧食局
衢州市人民政府僑務辦公室
衢州市級機關事務管理局
衢州市統計局
衢州市海洋與漁業局
衢州市安全生產監督管理局
衢州市新聞出版局
衢州市質量技術監督局
衢州市地方稅務局
衢州市體育局
衢州市工商行政管理局
衢州市廣播電影電視局 衢州市文物局
衢州市監獄管理局
衢州市公務員局
衢州市能源局
衢州市物價局
衢州市食品藥品監督管理局