個人所得稅費用扣除方式主要有三種:定額、定率、核算。根據《中華人民共和國個人所得稅法》，扣除標準如下:第六條應納稅所得額的計算:1。工資、薪金所得為每月收入減除費用3500元後的應納稅所得額。二、個體工商戶的生產、經營所得，以每個納稅年度的收入總額扣除成本、費用和損失後的余額為應納稅所得額。三、企業事業單位的承包經營和租賃經營所得，以每壹納稅年度的收入總額，減除必要的費用後的余額，為應納稅所得額。四、勞務報酬所得、特許權使用費所得、財產租賃所得，每項所得不超過4000元的，減除800元；超過4000元的，扣除20%的費用，余額為應納稅所得額。五、財產轉讓所得，以財產轉讓所得減除財產原值和合理費用後的余額為應納稅所得額。六、利息、股息、紅利所得、偶然所得和其他所得，為每項應納稅所得額。個人對教育和其他公益事業的捐贈部分，按照國務院的有關規定從應納稅所得額中扣除。對在中國境內無住所但取得工資、薪金所得的納稅人，以及在中國境內有住所但取得中國境外工資、薪金所得的納稅人，可根據其平均收入水平、生活水平和匯率變動情況確定附加扣除。附加扣除的適用範圍和標準由國務院規定。