2011年7月7日，經陜西省人民政府批準，商洛市商州區紅門河鄉撤銷並入黑龍口鎮，孝義鎮、白洋澱鎮撤銷並入夜村鎮，張村鎮撤銷並入沙河子鎮，李渺鄉並入石爻鎮，普峪鄉、龍王廟鄉並入板橋，鹽池河鄉、馬池河鄉、西井鄉、石爻鄉撤銷。
2015年2月，經陜西省人民政府批準，撤銷馬池河鎮、鹽池河鎮，並入謝陽鎮，撤銷上官方鎮，並入閻村鎮，撤銷西井鎮，並入大井鎮，撤銷黑龍口鎮，並入牧虎關鎮。在原馬池河鎮、鹽池河鎮、黑龍口鎮、上官方鎮、西京鎮設立便民服務中心。商州區合並鎮後轄14個鎮和4個街道辦事處。合並130個村，保留255個村。保持31社區居委會不變。劃分詳情:2014年8月，商洛市商州區轄4個街道、14個鎮:城關街道、大趙峪街道、陳語安街道、劉灣街道、葉村鎮、沙河子鎮、楊峪河鎮、金陵廟鎮、黑山鎮、謝陽鎮、馬街鎮、牧虎關鎮、大井鎮等。