其中稅務檢查主要包括：壹是負責控管納稅人的日常檢查，包括因清理漏管戶、核查發票、催報催繳、評估問詢、了解納稅人生產經營和財務狀況等管理事項，到納稅人生產經營場所調查與稅收相關的情況和賬冊檢查；因申請註銷稅務登記、退稅、確認獲利年度等納稅人日常申報事項，觸發的調賬檢查；二是對日常管理過程中發現的偷、逃、騙稅等稅收違法行為實施稅務檢查。
寶安區地方稅務局內設辦公室、人事監察科、計劃財務科、征管科、政策法規科、信息管理科和行政科等7個綜合科室，1個重點稅源管理、2個專業管理科和4個綜合管理科等7個稅源管理科，以及新安、西鄉、石巖、福永、沙井、龍華、民治、大浪、觀瀾、松崗等10個稅務所。