聖元奶粉是有問題的，聖元奶粉性早熟是典型的，為大眾所熟知。2010聖元奶粉被認為添加了激素含量超標，因為武漢三名女嬰出現性早熟，期間壹直在喝聖元奶粉。但後來相關專業機構的檢測報告得出結論，市面上的奶粉並沒有因為激素超標導致性早熟，但這壹事件還是對聖元造成了不良影響，讓部分消費者對國產奶粉越來越失去信心。
2008年呢？在三鹿奶粉事件中，國家對市場上的奶粉進行了抽檢，發現大部分奶粉三聚氰胺超標，聖元也在其中。之後要求所有奶粉下架。
三聚氰胺事件後，壹些質量檢測不合格的奶粉被列入黑名單。也是在這件事之後，國家對奶粉的質檢更加嚴格。現在很多奶粉都不在黑名單上，青島聖元奶粉就是其中壹個被撤下黑名單的。