稅務登記證丟失辦理註銷流程：
1、登陸公示系統，將營業執照辦理遺失公示；
2、在當地紙媒上向社會公眾公示稅務登記證遺失的公告；
3、當營業執照與稅務登記證都公示完畢後，申請者就可以開始走註銷流程；
4、整理個體戶近3-5年的賬簿、記賬憑證等等材料；前往稅務局辦理稅務註銷登記，取得清稅證明；
5、若當稅務出現異常的話，則必須先根據異常原因做好相關準備，申請將異常移除。
二、分析
納稅人、扣繳義務人遺失稅務登記證件的，應當自遺失稅務登記證件之日起15日內，書面報告主管稅務機關，如實填寫稅務登記證件遺失報告表，並將納稅人的名稱、稅務登記證件名稱、稅務登記證件號碼、稅務登記證件有效期、發證機關名稱在稅務機關認可的報刊上作遺失聲明，憑報刊上刊登的遺失聲明向主管稅務機關申請補辦稅務登記證件。
三、稅務登記證在哪裏辦理？
從事生產經營的納稅人，要在領取營業執照之日起30日內到辦稅服務廳申辦稅務登記，納稅人辦理稅務登記時，先從主管稅務機關領取稅務登記表，按要求填寫後簽字或蓋章，連同其他證件、資料遞送到辦稅服務廳稅務登記窗口進行申報。稅務機關自收到申報之日起三十日內審核並發給稅務登記。