1、打擊職能，是開展稅務稽查的最主要目的，作用是嚴肅查處各種稅收違法犯罪行為，嚴厲打擊偷逃稅分子，維護稅法尊嚴，保障正常的稅收秩序。
2、震懾職能。通過對稅收違法行為的查處打擊，可以對心存僥幸、有潛在違法動機的納稅人起到震懾、警示和教育作用。
3、促管職能。對通過稅務稽查發現的稅收征管中的漏洞和薄弱環節，提出加強和改進征管的措施建議，使稅收征管水平和質量得到提高。
4、增收職能。稅務稽查可作為堵塞稅收漏洞的防線，追補偷逃的稅收，增加稅收收入，減少稅收流失。