註冊會計師是準入類考試，稅務師是水平評價類考試。稅務師考試更加註重“稅”，考試中也需要考生掌握壹定的會計知識，去解決與“稅”有關的問題。而註會則更為註重會計類的知識。
稅務師的涉稅鑒證是依據稅收法律、法規，對被鑒證單位涉稅事項的真實性、合法性發表意見，從而為稅收征納雙方提供合法、準確的涉稅信息，其執業行為的目的是對國家稅收利益和納稅人合法權益負責。
註冊會計師的財務審計，是依據會計法律、法規，對被審計單位財務報表是否真實和公允發表意見，其執業行為的目的是對股東等投資者負責。由於執業目的不同，註冊會計師同時提供“審計業務”和“非審計業務”，可能會造成審計質量的下降。