現有內設科室9個：辦公室、政策法規科、流轉稅管理科、所得稅管理科、征收管理科、計劃財務科、人事科、教育科、監察室；事業單位3個：信息中心、機關服務中心、發票管理所。下設7個市區分局：鐵東管理分局、經濟開發區管理分局、中央路分局、鐵西管理分局、工業園區管理分局、稽查局、遼河農墾管理區分局；5個縣（市、區）局：公主嶺市局、雙遼市局、梨樹縣局、伊通滿族自治縣局、公主嶺國家農業科技園區局。全市國稅系統現有幹部1073人，負責四平市1242戶國有企業、1432戶集體企業、47戶涉外企業、1613戶有限責任公司（含私營企業）、283戶其他企業、 16894戶個體工商業戶***21511戶納稅人的稅收征管工作。