物流輔助服務應納稅額計算方法，壹般計稅方法：納稅人適用壹般計稅方法時，適用6%的稅率計算增值稅。由於人力成本無法取得進項稅額，物流輔助服務的進項稅額主要來自於場地與設備的購置、租賃費用。簡易計稅方法：壹般納稅人提供倉儲服務、裝卸搬運服務、收派服務可以選擇適用簡易計稅方法，按3%的征收率計算繳納增值稅。
二、分析詳情
物流輔助服務包括：航空服務、港口碼頭服務、貨運客運場站服務、打撈救助服務、貨物運輸代理服務、代理報關服務、倉儲服務和裝卸搬運服務。
三、相關法律
《中華人民***和國契稅法》 第三條，契稅稅率為百分之三至百分之五。契稅的具體適用稅率，由省、自治區、直轄市人民政府在前款規定的稅率幅度內提出，報同級人民代表大會常務委員會決定，並報全國人民代表大會常務委員會和國務院備案。省、自治區、直轄市可以依照前款規定的程序對不同主體、不同地區、不同類型的住房的權屬轉移確定差別稅率。
四、物流輔助服務的核算
如果是接受的物流輔助服務，是通過銷售費用等科目核算，賬務處理是：借：銷售費用等科目，貸：銀行存款等科目。