小額貸款公司主要涉及的稅種有增值稅、附加稅、印花稅、企業所得稅，個人所得稅。
小額貸款的公司應當依法繳納企業所得稅，這個是所有公司都必須繳納的稅務。小額貸款公司可以由企業的法人或自然人設立，但公司性質均為有限責任公司或股份有限公司。雖然自然人符合規定條件也可設立小額貸款公司，但由於新企業所得稅法實行法人所得稅制，《中國銀行業監督管理委員會、中國人民銀行關於小額貸款公司試點的指導意見》及實施條例規定，在中國境內，企業和其他取得收入的組織依照本法的規定，就其年度應納稅所得額繳納企業所得稅，適用稅率25%。