下設離退休幹部管理處(副處級，隸屬於人事部)。負責離退休幹部的管理和服務工作，指導本系統離退休幹部的管理和服務工作。負責對本系統各級國稅機關及其工作人員執行黨和國家的路線、方針和稅收法規的情況進行監督檢查；負責本系統黨的紀律檢查、行政監察和廉政建設工作；負責執法監督和整改工作；負責管理幹部信訪、違法違紀案件和系統內重大案件的查處。
政府黨委辦公室。負責局機關和直屬單位的黨務、工會、青年和婦女工作；負責局機關的思想政治工作和黨群工作。