財務專用章和發票專用章區別如下：
1、財務章主要用於財務結算，開具收據、發票（有發票專用章的除外）給對方、銀行印簽必須留財務專用章等等，能夠代表公司承擔所有財務相關的義務，享受所有財務相關的權利。壹般由企業的專門財務人員管理，可以是財務主管或出納等。會計中心對財務專用章的使用範圍嚴格限制，並采取與會計主管印章雙人分管、保險櫃另行存放等項措施，以確保印鑒安全。
2、發票專用章是指企業、單位和個體工商業戶購買和開具發票時須加蓋“發票專用章”。