財政局和稅務局的職能不同，即:
(1)財政局:主要負責地方財政工作，執行財政制度，按政策組織財政收入，保證財政支出，管好用好地方財政資金，促進工農業生產和各項事業的發展；培養專職會計人員，提高科學財務管理素質和企業財務管理水平；嚴格財經紀律，提高經濟效益；積極開發金融資源為振興地方經濟服務。
(2)稅務局:目前我國的稅務局分為國稅局和地稅局。地方國家稅務局直屬中華人民共和國國家稅務總局領導，地方稅務局受當地省(市)政府領導。國稅局和地稅局都屬於政府機關(行政單位)。