1、納稅期限的不同:個稅預繳的納稅期限壹般為納稅人在月度或者季度終了後十五日內;而綜合所得個稅匯算清繳應當在取得所得的次年三月壹日至六月三十日內辦理,經營所得個稅匯算清繳應當在取得所得的次年三月三十壹日前辦理。
2、申報方式的不同:企業為員工進行個稅預申報和預繳的,需要通過“自然人電子稅務局(扣繳端)”提交申報和繳納稅費;員工個人年度完成匯算清繳工作的,需要通過“個人所得稅APP”自行提交申報。