增值稅稅負低由稅務機關的哪個科室處理

稅務稽查科。增值稅稅負低稅務稽查科會認定企業有偷稅、漏稅嫌疑，觸發預警系統，列為重點稽查對象，即由稅務機關的稅務稽查科處理。廣義稅務機關，稅務術語，是指國家稅務總局及其所屬征收機關，包括各級稅務機關（狹義）、海關（關稅）、財政機關（契稅等）。狹義稅務機關指各級稅務機關，不包括海關、財政機關。