辦公室內設13職能處室:稅務行政1、稅務行政2、稅務行政3、辦公室、人事處(教育處)、基層工作處、計劃會計處、稅收征收管理處、政策法規處、監察室、稽查總隊(稽查分局)、直屬分局、直屬分局、1事業單位(稅務培訓中心)下轄11市(地)、77個縣(市、區)局。1994年8月，全省地稅系統幹部職工8800人。1994的稅收60.75億元。1997年8月進壹步組建省國地稅機構，10年10月進壹步組建並按各自征管範圍獨立運行。1997年，全省地稅系統幹部職工15999人，全年稅收1283億元。
1997進壹步劃分後，至2002年6月底，省局共有11個職能部門:辦公室、政策法規處、稅收管理壹科、稅收管理二科、稅收管理三科、涉外稅收管理科、收費管理科、征收管理科、稽查局、計劃財務部、人事教育處(基礎工作)4個直屬機構:直屬稅收征管壹科、直屬稅收征管二科4個直屬機構(信息中心、浙江稅務編輯部、稅票管理中心、稅務培訓中心)；下轄杭州、寧波、溫州、紹興、嘉興、湖州、金華、衢州、臺州、舟山、麗水11市局和81縣(市、區)局。
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