徐桴（聖禪）任總司令部軍需處長，邀朱鏡宙任副處長。朱鏡宙乃辭中國銀行職，到南京總司令部服務，其間會隨侍蔣總司令屢赴前線。壹九二八年春，總司令部參謀處長陳焯任二十六軍軍長，委任朱鏡宙為軍需處處長。壹九二九年五月，蔣主席發表和平統壹宣言，二十六軍自山東復員，朱鏡宙離職。徐桴出任上海市財政局長，邀朱鏡宙任財政局秘書，並籌備上海市銀行，兼南市分行經理，代理市庫業務。壹九三三年五月，前革命軍總司令部參謀長朱紹良出任甘肅省主席，邀朱鏡宙任財政廳長兼禁煙局長。朱鏡宙在甘省三年，興利除弊，成績卓然。壹九三六年四月，朱紹良辭省主席職，由東北系將領於學忠繼任，朱鏡宙赴京謁蔣委員長，辭職離甘。後以張學良、於學忠堅留，朱鏡宙請示蔣公後，與於約效力六個月為期，至十月辭職。朱鏡宙在甘期間，聘倪文亞於秘書，對之襄助良多。
朱鏡宙南歸，途經西安，陜西省主席邵力子力挽其任陜西財政廳長，到任月余，西安事變發生，為楊虎城軟禁於陜西省銀行。事變結束，朱鏡宙辭職離陜，返南京以書面向蔣委員長報告事變經過，然後赴上海療養。
壹九三七年抗戰軍興，十壹月，財政部任命朱鏡宙為川康稅區稅務局長，朱鏡宙赴漢口謁孔祥熙部長，後買輪入川，赴成都接事。任職三年，兩度深入川康腹地，巡視榷務，稅收由每月三十萬元，至卸任時增加壹倍以上，而稅局支出較前任每月減少五千余元。