出口退稅系統整合意義是提升了跨境貿易便利度。稅務部門通過整合出口退稅系統，進壹步提升了跨境貿易便利度。在沈陽，稅務部門推出出口退稅隨報隨審隨退，符合條件的企業當天申報，最快壹天退稅就能到賬。在廣西，納稅人體驗到了報送表單從7張減到2張的便捷，發票和報關單信息都可以直接讀入，整體申報效率提升近3成。
出口退稅系統的作用
增強了我國出口貨物的競爭能力，進-步優化了出口商品結構。1978年-1994年工業制成品占出口總額的比重由46.5%上升到83.7%，有力地促進了進口貿易的發展。加強了對出口企業的退稅管理和稅務監督，有力地支持了外貿體制的改革，促進了出口企業向自主經營、自負盈虧的經營機制的轉變。