稅務局要查妳公司的發票，是查有沒有漏稅情況，壹般的要查增值稅發票，這個是完全不能偽造的，肯定要查交易的，當時交易人交易憑證這些都要是原始的，如果提供不出來可能就要被罰款了。
公司從其他單位開過來的發票，稅務局向出票單位發協查函的原因是“四小票”系統提示的比對異常發票，這類發票不壹定全是有問題發票。有些是發票錄入時時間、金額、代碼等等誤輸，也有存根聯進入系統，抵扣聯未進入系統，也有虛開發票比對不符的。這種情況，可以壹要求稅務部門與對方稅務部門溝通，如果純粹是錄入錯誤，爭取簡化處理，二是根據稅務部門要求對方稅務機關重新發函。