根據《財政部、國家稅務總局關於增值稅、營業稅若幹政策規定的通知》{財稅字〔1994〕第026號}，規定：
“五、關於代購貨物征稅問題
代購貨物行為，凡同時具備以下條件的，不征收增值稅；不同時具備以下條件的，無論會計制度規定如何核算，均征收增值稅。
（壹）受托方不墊付資金；
（二）銷貨方將發票開具給委托方，並由受托方將該項發票轉交給委托方；
（三）受托方按銷售方實際收取的銷售額和增值稅額（如系代理進口貨物則為海關代征的增值稅額）與委托方結算貨款，並另外收取手續費。”
按照妳公司的做法，不能以代購行為繳納營業稅，而是按代銷業務，視同銷售處理。至於如何納稅，就看妳公司和供應商是不是壹般納稅人、如何繳納（和抵扣）關稅、進口增值稅等等。