單位需要通過登錄自然人電子稅務局網站進行個人綜合所得集中匯算清繳，授權財務人員進行集中申報。具體操作流程如下:
1.對財務人員的授權(做過實名辦稅的財務人員不需要再次授權)。
方式壹:企業法人/財務負責人登錄個人所得稅app-個人中心-企業稅務機關-添加授權人員。
方式二:企業法人/財務負責人登錄自然人電子稅務局(網頁版)-完善個人信息-稅務機關管理-點擊詳情-添加授權人員。
登錄自然人電子稅務局(網頁版)申報，
第壹步:授權財務人員登錄自然人電子稅務局(網頁版)，選擇對應的匯款單位。他們可以輸入該單位的省、市和稅號進行搜索，然後點擊立即申報。
註意:集中匯款不支持逾期處理。扣繳義務人在為納稅人辦理匯算清繳時，應在6月30日前填寫相關表格並辦理後續退稅等相關事宜。
第二步:填寫並提交報告——可以直接添加，也可以用模板導入。檢查完數據後，單擊提交。
第三步:退稅申請——如果退稅狀態為待退稅或放棄退稅，可以提交退稅申請。
第四步:繳稅——申報單提交成功後如有欠稅，可點擊繳稅辦理繳稅業務。
第五步:申報查詢-點擊申報記錄查詢，查詢申報數據。