營業稅、城市維護建設稅（不包括上述由國家稅務局系統負責征收管理的部分），地方國有企業、集體企業、私營企業繳納的所得稅、個人所得稅（不包括對銀行儲蓄存款利息所得征收的部分），資源稅，城鎮土地使用稅，耕地占用稅，土地增值稅，房產稅，城市房地產稅，車船使用稅，車船使用牌照稅，印花稅，契稅，地方稅的滯納金、補稅、罰款。
為了加強稅收征收管理，降低征收成本，避免工作交叉，簡化征收手續，方便納稅人，在某些情況下，國家稅務局和地方稅務局可以相互委托對方代收某些稅收。
另外，對於特殊情況，國家稅務總局會對某些稅種的征收系統，做出特別的安排和調整.因此，納稅人涉及具體稅種應當向哪個稅務系統繳納問題時，還是應當以當地主管國家稅務機關和地方稅務機關的實際分工及其具體要求為準。