電子普通發票是普票，不屬於增值稅專用發票，所以不能用來抵消扣除進項稅額。增值稅發票分為普票和專用發票，其中專票是可以用來抵消扣除進項稅額。
電子發票和增值稅發票區別：
1、形式上的區別。電子發票就是電子形式的發票。增值稅發票是紙質的發票，分為增值稅普通發票和增值稅專用發票；
2、抵扣上的區別。電子發票原來屬於普通發票，現在也有了電子專用發票。不論是紙質專票、還是電子專用發票都可以抵扣；
3、取得方式的區別。電子發票是通過電子發票服務平臺查詢、下載取得的。傳統紙質發票是銷售方直接開出來、購買方拿到的。
綜上所述，電子普通發票不屬於增值稅，無法抵扣進項稅額。除了壹些特殊的普通發票，如運費普通發票，收購農產品普通發票，其他的普通發票是不可以抵扣進項稅的。
法律依據：
《中華人民***和國發票管理辦法》第二十三條
安裝稅控裝置的單位和個人，應當按照規定使用稅控裝置開具發票，並按期向主管稅務機關報送開具發票的數據。
使用非稅控電子器具開具發票的，應當將非稅控電子器具使用的軟件程序說明資料報主管稅務機關備案，並按照規定保存、報送開具發票的數據。
國家推廣使用網絡發票管理系統開具發票，具體管理辦法由國務院稅務主管部門制定。