登錄網上電子稅務局，選擇“我要辦稅”—“稅費申報及繳納”—“其他申報”。
選擇需要繳納的起止時間，在下拉框中選擇“殘疾人就業保障金申報表”，點擊添加。
申報表添加成功後，點擊申報，依次在表內填入年工資總額，年平均職工人數，已安排殘疾人就業人數，系統會自動計算出應繳納的稅額。可以和自己計算的進行對比，確認無誤後，點擊下方的申報。
申報完成後，返回添加界面，點擊稅款繳納，進行網銀扣款。
保障金年繳納額=（上年用人單位在職職工人數X所在地省、自治區、直轄市人民政府規定的安排殘疾人就業比例-上年用人單位時間安排的殘疾人及就業人數）X上年用人單位在職職工年平均工資。
法律客觀 ：
《殘疾人就業條例》
第十六條依法征收的殘疾人就業保障金應當納入財政預算，專項用於殘疾人職業培訓以及為殘疾人提供就業服務和就業援助，任何組織或者個人不得貪汙、挪用、截留或者私分。殘疾人就業保障金征收、使用、管理的具體辦法，由國務院財政部門會同國務院有關部門規定。財政部門和審計機關應當依法加強對殘疾人就業保障金使用情況的監督檢查。