分公司企業所得稅能不能獨立繳納取決於該分公司是否獲得了稅務局的批準進行獨立核算。即使分公司是獨立核算的，也不意味著必須與總公司分別計算繳納企業所得稅實際上，分支機構是否獨立核算，這只是會計核算上的規定，並不影響企業所得稅匯總繳納的規定。以2008年開始實施的《企業所得稅法》為標誌，企業所得稅的納稅人是具有法人資格的經濟組織，在2008年之前，企業所得稅納稅人是獨立核算的經濟組織，而當下的所得稅法規較少提及“獨立核算”因此即便分公司申請了獨立核算，也需要按照稅法規定與總公司壹起匯總繳納企業所得稅，除非稅務局有特殊規定或審批同意分公司獨立繳納。
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