福建省國家稅務局是福建省主管國家稅收工作的行政機構，由國家稅務總局實行垂直管理。全省國稅系統設置9個設區市局，87個市（縣、區）局，下轄366個稅務分局（副科級）和10個稅務所（正股級）。省局機關內設13個處室和1個機關黨委辦公室，1個直屬機構稽查局和5個事業單位。
2018年6月15日，國家稅務總局福建省稅務局正式掛牌成立，標誌著原福建省國稅局、原福建省地稅局完成合並。