個人獨資企業業主應繳納的稅款包括增值稅、城建稅、教育費附加、地方教育費附加、個人所得稅等。獨資企業不具有法人資格。雖然是企業，但實際上是按照個體工商戶的生產經營所得征收個人所得稅。
法律客觀性:
《個人所得稅法》第十二條:納稅人取得經營所得後，按年計算個人所得稅。納稅人應當在每月或者季度終了後15日內向稅務機關報送納稅申報表，預繳稅款。次年3月31日前結清收入。納稅人的利息、股息、紅利所得，財產租賃所得，財產轉讓所得，偶然所得，按月或者按季計算。有扣繳義務人的，由扣繳義務人按月或者按季代扣代繳稅款。