公司被個稅申訴,稅務局會查賬嗎,由哪個部門查賬

會。當公司被個稅申訴的情況下，稅局會通知單位去解釋被申訴的原因，如果解釋不清，會被認為是有意控制工資薪金的申報，從而減少企業所得稅的繳納，有構成逃稅嫌疑，導致查賬或者補交稅款的情況，其稽查局是專門查賬的部門。稅務機關是主管我國稅收征收管理工作的部門。

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