前往公司所在地的稅務局，提交代扣協議申請，提交申請時，需要提供公司的稅務登記證、公章、法人章等相關材料。
稅務局會對申請進行審核，如果審核通過，會與公司簽訂代扣協議，簽訂協議後，公司每個月需要向稅務局申報增值稅，並且稅務局會自動從公司賬戶中扣除相應的稅款。
需要註意的是，代扣協議的簽訂並不意味著公司不需要進行其它的稅務申報和繳納工作，例如所得稅、營業稅等其它稅種的申報和繳納工作仍然需要進行。同時，如果公司存在其它稅務問題或爭議，也需要及時與稅務局溝通解決。