這屬於該香港公司在大陸取得的應稅收入，妳公司負有代扣代繳的義務。
分別到國地稅機關進行申報，營業稅按照服務業稅目走，稅率5%；非居民企業所得稅到國稅局申報，稅率為10%，基數均為該筆收入全額。
2.如果超過3萬美元的話，還必須國地稅機關分別開具支付服務貿易付匯證明。
3.付款後，妳公司應取得香港公司的發票或者類似憑據，作為企業所得稅稅前列支的依據。
4.具體辦理步驟請咨詢當地國地稅機關。
PS：
1.大陸和香港雖然是壹個國家，但是是不同稅制的，香港是單獨的稅制的，所以中國大陸和香港簽訂了稅收安排（因為香港是屬於中國的，所以簽訂的叫稅收安排，中國和別的國家簽的叫協議），如果要享受稅收安排的話，也就是證明他在香港交企業所得稅而不在大陸交，讓他拿香港居民稅收證明等過來，就可以不用交，否則，該香港公司還是要將該筆非居民企業所得稅妳還是要承擔扣繳義務。
2.這個稅是香港公司交的，跟妳沒關系，他該交多少，妳就扣多少，妳就告訴他是稅務局要交的。
個人意見，僅供參考