廣州市天河區國家稅務局內設機構為11個，級別為正科級，即：辦公室、政策法規科、稅政科、收入核算科、納稅服務科、征收管理科、財務管理科、進出口稅收管理科、人事教育科、監察室、辦稅服務廳。其中財務管理科掛靠收入核算科，納稅服務科掛靠征收管理科。
另設機關黨委辦公室（正科級）和離退休幹部科（副科級，掛靠人事教育科）。 組織落實幹部人事管理制度；承擔機構編制、幹部任免、人員調配、勞動工資、人事檔案、公務員管理、專業技術職務管理等人事工作；承擔管理權限內領導幹部和後備幹部的管理、考核及監督工作；監督檢查本單位執行幹部人事規章制度情況。組織實施本單位稅務文化建設和基層建設；擬訂並組織實施人員培訓、學歷教育工作規劃、年度計劃，開展培訓質量考核與評估。
離退休幹部科 承擔本單位離退休幹部的服務和管理工作。 負責納稅人到稅務機關辦理的各種涉稅事項，具體包括稅務登記、納稅申報、稅款征收、稅款解繳、欠稅公告、發票購銷、稅法宣傳、金稅發售、報稅稽核、咨詢輔導和受理減免申請及有關優惠政策申請等。
另設機關黨委辦公室，負責單位的黨群、黨建工作；承擔思想政治工作和精神文明建設；指導工會、***青團、婦委會工作；承擔入黨積極分子的教育培訓考察工作及發展黨員工作。