區別：
1、第壹稽查局：承擔杭州市上城區、下城區、江幹區的稅務稽查工作。
2、第二稽查局：承擔杭州市西湖區、拱墅區、濱江區的稅務稽查工作。
補充說明：
1、國家稅務局是行政單位，不是事業單位(國家稅務局下設的學校、培訓中心等才是事業單位)。?國家稅務局實行中央、省、市縣的垂直領導體制。國家稅務局主要負責征收中央稅以及中央與地方***享稅等稅收，地方稅務局主要負責征收地方稅等(詳細分工略)。國家稅務局與北京的國家稅務總局是兩個不同的概念。
2、稽查局是國家稅務總局主管稅務稽查工作的職能部門。主要職責是:起草稅務稽查法律法規草案、部門局所用設備章及規範性文件;辦理重大稅收案件的立案和調查的有關事項並提出處理意見;指導、協調稅務系統的稽查工作。