菏澤市牡丹區個體戶打印發票的主要步驟是:首先需要辦理稅務登記；其次，他們需要用個人身份證打印發票，向稅務機關申請填表審批；然後他們購買壹系列適合打印發票的設備；最後，他們在申請系統後安裝壹個免費的發票系統。
機打發票是指由專用打印機開具的壹種發票，屬於正規發票的壹種，經稅務機關認可，具有壹定的法律效力。