按照有關社保政策規定，社保和醫保由社保部門繳費核定後，由稅務部門征收。醫保交給稅務局的原因：
1、既然已經整合，就不宜再像之前壹樣，實行城鄉兩地分頭管理，由不同的部門征收。
2、新農合和原來的城鎮居民醫療保險，由於管理部門不同，征收參合和參保費用的部門也不壹樣，兩者之間互不幹涉，各管自己的那壹塊，各自為政，各自負責。
3、是為了便民。
4、原來的新農合，由衛生計生部門經辦，參保農民繳納的參保資金由地方財政部門征收時，往往是先由每個村子安排人手代為收款後，再統壹繳納到地方財政部門。