根據中國的稅務法規定，會計憑證的備案是由稅務部門進行的。稅務部門會對企業的會計憑證進行備案登記，以確保企業的會計記錄符合稅法規定，並進行稅務核算和監督。備案的目的是為了加強稅務監管，確保企業的會計記錄真實、準確，並遵守稅法規定。