火炬年報和高企年報區別是：適用範圍不同、匯報單位不同。
1、適用範圍不同。
火炬年報主要反映火炬企業在技術創新、產業發展、人才培養等方面的情況，以及使用火炬計劃資金的情況。高企年報內容涵蓋公司經營狀況、財務狀況、科技創新等方面的情況。
2、匯報單位不同。
火炬年報是科技部那邊要求填寫的。高新企業年報是科創委要求填寫的。
相關規定
火炬計劃統計報表的內容包括高新區區內企業和區外企業情況、高新區綜合情況、國家級火炬計劃項目執行情況、地方火炬計劃實施情況、科技企業孵化器情況、大學科技園情況、留學人員創業園情況、國家火炬計劃軟件產業基地情況、火炬計劃特色產業基地情況等。
以上屬於本統計調查範圍內的各統計單位實行年報制度。為及時掌握火炬計劃進展情況，火炬計劃統計還建立年度快報制度。除此之外，高新區要完成季報工作。