稽查局查賬公司拒絕配合，會計人員應承擔的責任有：
1、如稽查局發現公司賬務涉及重大問題的，情節嚴重，可能會涉嫌犯罪。
2、《行政監察法》第二章第十三條明確：“國家監察機關的監察人員依法執行職務，受法律保護，任何組織和個人不得拒絕、阻礙監察人員依法執行職務。”
稽查局查賬流程：
壹、重點檢查，企業犯事了，不知稅務想查什麽。
二、隨機抽查，每年稅務有檢查任務，管轄的眾多企業抽簽隨機產生，相當於例行檢查，無目標性,只是隨興翻閱：
1、國稅主攻應收賬款是否有貸方余額長期掛賬(隱瞞收入嫌疑)、應付賬款貸方長期大額掛賬(虛假接受發票嫌疑)；報表總賬是否和稅表壹致；應收賬款記錄是否有誤(計入其他應收款、其他應付款)，不註重檢查付款發票真假，但是銷貨發票開具範圍是稅務檢查的內容。
2、進項發票是否應該抵扣、有無敏感度、是否有銷售實現未開發票的跡象、應收賬款是否有異常、產成品發生是否異常,發出商品是否異常。
3、地稅檢查發票是否合理合法(問題發票壹看就知道，上面妳說的問題,稅務有查票軟件，問題票上網壹查就知道)；費用歸集是否合理；成本核算、結轉是否合理;稅金提取是否正確、是否有漏稅。
三、專項檢查
稅務對某個稅種涉及的內容進行檢查。
四、日常抽查
稅務人員年內到企業檢查次數有規定，屬於防患於未然。