吉林省煤田地質系統始建於1953年。 1998年全國煤炭地質勘探系統下放地方管理。1999年3月12日吉林省煤田地質局正式組建。局的行政級別為副廳級。吉林省煤田地質局原隸屬於吉林省煤炭工業局領導，2009年，隨著吉林省煤炭工業局撤銷和吉林省能源局正式成立，吉林省煤田地質局正式劃歸吉林省能源局管理。是省財政壹級預算單位。局機關現設7個職能管理處室，分別為：行政辦公室、黨委辦公室、財務審計處、人事處、規劃發展處、地質勘查處、裝備管理處。
全局主要負責組織並實施全省煤炭以及煤層氣勘查、煤田預測、煤田地質研究工作；負責全省煤田地質系統的資產經營管理和國撥地勘事業費管理；負責制定全省煤田地質發展規劃；負責擬定煤田地質系統改革方案，指導其所屬單位的改革與發展；承擔國家和全省基礎性、公益性、戰略性地質勘查項目研究工作。是壹支具有9個甲級、10個乙級、7個丙級勘查資質等級的地質專業化隊伍，同時具有非開挖和建築基礎兩個壹級資質等級 。