1、服務範圍不同：江蘇醫保雲服務對象主要是江蘇省範圍內的醫保參保人員和醫療機構。國家醫保服務平臺服務對象是全國範圍內的醫保參保人員和醫療機構。
2、服務內容不同：江蘇醫保雲主要提供江蘇省內參保人員和醫療機構相關的醫保服務，包括醫保參保、查詢、繳費、預約掛號、在線問診等。國家醫保服務平臺提供的服務內容也更加全面，包括醫保信息查詢、在線投訴、醫療機構評價、定點醫院查詢、遠程醫療、互聯網醫院等。