考慮到金融碩士和金融學碩士在考試試題、培養方式、課程設置、導師制度、讀博要求等方面存在差異，本文將對這些差異進行詳細介紹。
考試試題不同金融碩士：英語壹或英語二、數學三或396經濟類聯考綜合、金融學綜合、思想政治理論。金融學碩士：英語壹、數學三、經濟學、思想政治理論。
培養方式不同金融碩士是應用性碩士，2年。金融學碩士：學術性碩士，壹般三年。
課程設置不同金融碩士偏重於實務，學習目的為了解決實際工作中的問題，側重於金融工具、計量經濟學、統計學等。金融學碩士著重學習高級微觀、高級宏觀、金融思想史等。
導師制度不同專業碩士采取雙導師制度，即社會導師和校內雙導師。
讀博要求不同專業碩士不能直接讀博，但可以考博，即不能直接保送讀博，學術性研究生目前改革試點院校提供較少比例的直博名額，入學篩選後確定。