1，杭州零售藥店跨地區納稅，跨地區縣經營的機構增值稅應稅收入如何申報納稅:屬於固定業務的納稅人，向其機構所在地主管稅務機關申報納稅，其總機構和分支機構不在同壹市(縣)的，分別向其機構所在地主管稅務機關申報納稅。分支機構為非獨立核算戶的，應向總機構報送賬戶，由總機構匯總納稅並向總機構所在地主管稅務機關申報。如果所有分支機構都是獨立核算戶，經中華人民共和國國家稅務總局或其授權的稅務機關批準，總機構可以向總機構所在地主管稅務機關匯總申報納稅。2.《跨地區經營匯總納稅企業所得稅征收管理暫行辦法》(國稅發〔2008〕28號):以生產經營為主要職能的總機構和二級分支機構，就地分期預繳企業所得稅。但並不是所有跨地區設立營業機構和不具有法人資格場所的居民企業，都需要分期預繳企業所得稅，才能匯總納稅企業。3.跨地區經營的，應提交兩份財務報表。具體納稅方式為:總公司根據各分公司上壹年度營業收入、員工工資、資產總額計算各分公司應分享的增值稅比例，權重為0.35、0.35、0.30。計算公式如下:壹個分支機構的分配比例=0.35×(該分支機構營業收入之和/所有分支機構營業收入之和)+0.35 ×(該分支機構工資總額之和/所有分支機構工資總額)+0.30×(該分支機構資產總額/所有分支機構資產總額)。上述公式中的分支機構僅指需要當場預付的分支機構。壹旦按照上述方法確定稅收分成比例，當年不再調整。
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