在電子稅務局辦理外貿許可證的方式是登錄自己註冊地的電子稅務局；點擊我要交稅；綜合信息報告；稅源信息報告；跨區域稅務事項填報，網上提交，系統自動完成審批手續。
法律客觀性:
中華人民共和國國家稅務總局關於明確跨地區涉稅檢查管理有關問題的公告第壹條納稅人臨時跨省(自治區、直轄市、計劃單列市)從事生產經營活動的，應當向機構所在地稅務機關填報《跨地區涉稅事項申報表》(附件1)。第二條納稅人跨地區經營合同延期的，可以向其營業地或者機構所在地稅務機關辦理延長檢查管理有效期的手續。第三條跨區域報檢管理事項的報告、報檢、延期、反饋等信息應當通過信息系統在機構所在地和經營地稅務機關之間傳遞，並實時共享。第四條納稅人首次在營業地辦理涉稅事項時，應當向營業地稅務機關申請跨地區涉稅檢查。