從兩地以上取得工資、薪金所得的個人，由於兩地扣繳義務人在進行累計扣繳時已扣除了扣除費用，扣除專項附加扣除後的收入余額超過6萬元的，應當匯算清繳，繳納稅款。
但10月20日召開的國務院常務會議165438提出，對年綜合所得不超過12萬元或年納稅額較低的納稅人，免征匯算清繳義務。
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兩個發放工資薪金的單位，應按照《個人所得稅代扣代繳申報管理辦法(試行)》(中華人民共和國國家稅務總局公告2018第61號)的規定，按照累計扣繳法預繳個人所得稅。
根據《個人所得稅法實施條例》規定，納稅人同時從兩個或者兩個以上地方取得工資、薪金所得，扣繳義務人扣除專項附加扣除的，壹個納稅年度內只能從壹個地方取得的所得中扣除同壹專項附加扣除項目。
也就是說，對於在兩個以上地方取得工資薪金所得的個人的專項附加扣除，可以選擇在壹個地方扣除所有項目，也可以選擇在不同單位扣除不同項目，但壹旦選擇，壹個納稅年度不能改變。