南京市國家稅務局成立於1994年10月,下轄16個區縣局、1個直屬分局(大企業管理局)、1個稽查局,1個車購辦,現有幹部職工2161人,稽管納稅人19.9戶,其中增值稅納稅人17.3萬戶(壹般納稅人4.1萬戶),企業所得稅納稅人9.1萬戶。主要負責增值稅、消費稅、企業所得稅、儲蓄存款利息個人所得稅、車輛購置稅、金融保險營業稅等稅種以及進出口稅收的征管工作。