南京市總工會最早成立於1927年（民國16年）3月，是中國***產黨領導下成立的南京市第壹個地方工會。
南京市總工會委員會是中華全國總工會的地方組織，南京市工會主席由南京市工會代表大會選舉產生，南京市總工會是南京市各級工會組織的領導機關。
南京市總工會依據《工會法》和《中國工會章程》，以經濟建設為中心，按照“推動發展、改善民生、促進和諧”工作思路，大力實施“八大工程”建設、落實“六項措施”和每年為全市職工辦十二件實事，充分發揮南京工人階級主力軍作用，體現出南京工人階級創新、創造的偉大力量；南京市總工會積極發揮工會組織大學校作用。