南開大學金融學系始建於1920年，初名銀行學系，是南開大學最早的學科之壹。1954年，南開大學金融學系因院系調整停辦。1982年，在國家教委和中國人民銀行的支持下得以重建，設金融學專業。20世紀80年代中期，金融學系的學科建設得到迅速發展，壹大批著名的金融學科帶頭人雲集於此。在學術研究方面，國際金融市場、匯率制度、比較金融制度等領域的研究位居全國前列。在錢榮堃教授的倡導下，金融學系首創了中國和加拿大約克大學等三所學校聯合培養MBA學生的“南開—約克”模式，繼而創辦中加聯合培養國際金融博士班，借用國外的學術力量發展國際金融專業。
1984年，金融學系又先後設立了保險學專業和農村金融專業。1986年，國際金融被國家教委評為當時全國唯壹的國際金融重點學科。1999年，根據國家學科規劃要求，金融學系的國際金融學專業和貨幣銀行學專業合並為金融學專業。目前，金融學系設有金融學和金融工程兩個專業，其中金融學在國務院學位委員會評定的國內六大金融學重點學科中位居前列。
金融學系現有教師30余人，其中擁有高級職稱的教師超過30%，擁有博士學位的教師超過80%。重建27年以來，金融學系***為社會培養本科畢業生三千余人，博士、碩士千余人。