1994年，根據國務院《關於實行分稅制財政管理體制的決定》，經國家稅務總局和廣西壯族自治區人民政府批準，廣西國稅、地稅機構分設。經廣西壯族自治區地方稅務局批準，1994年9月22日南寧市地方稅務局掛牌成立，1995年1月1日起，南寧市地方稅務局獨立運行。