1、計算年終獎金：企業首先需要計算員工的年終獎金，確定應繳納的個稅金額。根據國家稅務局規定，年終獎金的個稅計算方式與月薪相同，但稅率不同；
2、申報個稅：企業需要在國家稅務局網站上下載個人所得稅申報表，並填寫相關信息，包括員工的個人信息、年終獎金金額、應繳納的個稅金額等；
3、繳納個稅：企業在提交個人所得稅申報表後，需要在規定時間內繳納員工的個稅。企業可以通過網銀、銀行轉賬等方式進行繳納。
年終獎單獨申報需要的資料如下：
1、個人身份證明：包括個人身份證、戶口本、社保卡等身份證明資料；
2、工資收入證明：包括個人所在企業的工資收入證明、個人所得稅繳納證明等；
3、年終獎金收入證明：需要提供年終獎金的發放證明，包括企業的發放憑證、收據等；
4、稅費繳納證明：需要提供個人所得稅繳納證明，包括個人所得稅申報表、稅務局開具的繳納證明等；
5、銀行轉賬記錄：如果年終獎金是通過銀行轉賬方式發放的，需要提供相關的轉賬記錄或銀行回單等證明文件。
綜上所述，企業在操作過程中需要註意遵循相關的稅務規定，確保個稅申報和繳納的準確性和合法性。
法律依據：
《中華人民***和國個人所得稅法》第九條
扣繳義務人每月所扣的稅款，自行申報納稅人每月應納的稅款，都應當在次月十五日內繳入國庫，並向稅務機關報送納稅申報表。