（3個，即：信息中心、機關服務中心,級別為正科級; 福建省國家稅務局莆田培訓中心，級別為副處級）。
（壹）信息中心。落實稅收管理信息化建設規劃和實施方案，執行信息系統管理制度和技術標準；承擔本系統信息化建設的技術支持、保障工作；承擔稅收管理信息系統的運行維護工作；組織本系統信息安全管理與實施。
（二）機關服務中心。承擔機關後勤事務的管理、保障和服務工作，擬訂機關事務具體工作制度並組織實施；承擔機關辦公用品的采購、保管、分配、維修；參與機關後勤體制改革工作；指導本系統後勤服務工作。?
（三）福建省國家稅務局莆田培訓中心。擬訂並組織實施人員培訓工作規劃、年度計劃,開展培訓質量考核與評估工作。